PLC yazılımı, CPU donanımının programlanması, I/O adreslerinin tanımlanması, haberleşme parametrelerinin ayarlanması ve çevrim içi teşhis kayıtlarının izlenmesi için kullanılan mühendislik ortamıdır. IEC 61131-3 standardı Ladder Diagram (LD), Function Block Diagram (FBD), Structured Text (ST), Sequential Function Chart (SFC) ve Instruction List (IL) dillerini tanımlar; güncel platformlarda ST ve grafik diller daha yaygındır. Mitsubishi MELSEC iQ-F ve iQ-R sistemleri GX Works3 ile, eski FX ve Q serileri çoğunlukla GX Works2 ile ilişkilidir. Omron CP1/CJ ailesi CX-Programmer, NJ/NX ailesi Sysmac Studio; Siemens S7-1200 ve S7-1500 ailesi TIA Portal/STEP 7 ortamıyla programlanır. Lisans tipi, desteklenen CPU nesli, Windows sürümü, USB/Ethernet sürücüsü ve proje dosyası biçimi aynı yazılım adında farklı uyumluluk sınırları oluşturur. Ayrıntılı sürüm ve lisans farkları PLC yazılımı seçim rehberinde açıklanır.